城素服三日，再守丧三十六日，虽说是傀儡皇帝，必要的礼仪却不可废，第四日，即十一月十四日清晨，司马睿薄葬于鸡笼山阳的兴平陵今南京市南京大学北园，裴妃称病，未去参加。
兴平陵按祖制，严格遵守了不坟、不树、不谒的三不原则，所谓不坟，即不堆土丘，地面没有寝庙、神道等标志性建筑，不树是陵区不种植任何松柏等树木，不谒则指不允许人主及群臣前往拜祭，这是司马懿定的规矩，原因有二。
首先是担心自已夺取曹魏江山的那一幕于司马氏重演，嘉平元年正月初六，辅国大臣曹爽陪同魏主曹芳进谒距洛阳城南九十里的高平陵祭祀明帝曹睿，被司马懿抓住机会，发动兵变，一举控制了曹魏政权。
曹氏拜陵丢江山，这是血淋淋的教训。
其次，因曹操兴起的盗墓在当时成了风尚，两汉帝陵，王公墓葬屡遭盗掘，这对司马懿立丧葬祖训也有影响。
其实晋室历代帝陵距都城极近，甚至有在皇宫边上下葬，恐怕也是为了防止京中有变来不及返回，被权臣夺了司马家江山。
下葬的次日，经朝臣商议，司马睿尊谥为元皇帝，义为始建国都曰元，主义行德曰元，庙号中宗。
司马绍并没有急于登基，钦天监测算了吉日，定为当月庚寅日，即十一月二十七日即皇帝位，在这之前，以太子身份监国，并对人事做了微调。
温峤被拜为侍中，可参与机密大谋，拟诏命文翰，有实权在身，庚亮一跃而为中书监，中书监与中书令职务相等，位次略高，另给王敦加了羽葆鼓吹殊荣，其余王导、荀菘等暂未变动，年号仍沿用永昌，次年改元太宁。
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