经过一场大战后，雨忍几乎败局已定，半藏也再没有负隅顽抗的能力，只好立即带领雨忍撤回了雨忍村，而雨忍村四周环水，易守难攻，木叶一时也难以攻进，于是战况就此陷入了僵局。
木叶军队试着进攻了雨忍村几次，但都是以失败收场，无奈之下，木叶只好派出使者，劝半藏主动投降，签订投降协议。
然而半藏却毫不客气的赶走了木叶的使者，宁死都不投降。
半藏不投降，雨忍村木叶的军队又攻不进去，而在这么干耗着，对木叶的补给又消耗太大，无奈之下，浮莹只好暂时选择了退兵，然后占领了几个雨之国的村庄，就地获取补给。
战争就这么僵持了几个月的时间后，木叶终于还是撤走了大部队，只留下一些小部队继续与雨之国僵持，而魂叶也被浮莹强行带回了木叶。
本来三忍也要跟随大部队一起撤离，但就在他们撤退的路上，他们却遇到了在战争中流离失所的三个孤儿，自来也因为不忍见他们孤苦无依，所以就决定留下来，照顾他们三人一段时间。
而这三个孩子正是弥彦，小南和长门。
自来也本来只是想将这几个孩子培养成人，让他们能够在这乱世中存活下去，但哪料到在机缘巧合之下，长门竟然意外暴露了他轮回眼的能力。
而见识到长门的轮回眼后，自来也立马想起了大蛤蟆仙人的预言，心中不禁猜想长门也许就是他要寻找的命运之子。
于是自来也才正式收他们三人为徒，在传授他们本领的同时，还教导他们追求和平的思想。
另一边，大部队在回到木叶后，所有人就立刻恢复了平静的生活，而魂叶此时却闲不下来，因为在回到木叶后，她立马看到了一个特殊的人物。
原来在那天回到木叶的时候，不少村民都跑来迎接各自的家人荣誉归来，而魂叶的家人凌子却没有出现，而她的族长浮莹却立马跑去火影大楼做汇报，所以魂叶只能无聊的打量四周，观察周围的其他人。
魂叶先是看到了悄无声息消失在人群中的大蛇丸，然后又看到人群中一个少年突然冲着纲手跑去，而纲手看到那个少年后，竟然破天荒的露出了温暖的笑容。
那个少年约么十一二岁，看起来十分阳光可爱，发色与纲手有一些类似，是棕黄色，而这个少年正是纲手的亲弟弟绳树。
“绳树已经这么大了，看来距离他遇难的事件应该不远了。”魂叶盯着一脸阳光的绳树，心情沉重的想道。
既然知道了绳树日后肯定会遇险，而且纲手还会因此遭受重大打击，而大蛇丸也会因此而黑化，开始追寻灵魂不灭的手段，魂叶便下定决心，一定要想方设法阻止此事的放生。
想到此处，魂叶便打算走上前与纲手和绳树打个招呼，趁机与绳树认识一下。
然而她才刚迈出一步，就突然脸色一凝，因为她撇到人群后方的一颗大树上，一个头戴面具的暗部忍者正盯着她。
那个暗部忍者见到魂叶后，立马向她做了一个特殊的手势，然后就一闪而逝，魂叶只好暂时放弃与她们二人打招呼的打算，立刻穿过人群，然后悄无声息的消失在街道上。
魂叶再次出现时已经来到了半藏的秘密地下室，原来刚刚的那个暗部忍者正是经常负责替半藏联系魂叶的忍者。
“不知半藏大人找我有何事？”魂叶此时虽然实力已经强过半藏，但却依旧在半藏的面前表现的恭恭敬敬，因为第二次忍界大战后，半藏马上就会活跃起来，所以她此时还不想与半藏撕破脸皮，而是依旧留在他的挥下，好趁机获得一些隐秘的情报。
“你这次私自与半藏交手闹出如此大的动静，你就没有什么好说的吗？”半藏的脸隐藏在黑暗之下，看不清他到底是什么表情，声音阴沉的问道。
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